A escolha do modo de desmaterialização é feita de acordo com a sua organização interna, o seu sistema de informação. 2 modos à escolha:

• PDF não assinado que corresponde ao modo de Registo de auditoria que implica que seja capaz de estabelecer um registo de auditoria fiável entre a fatura e a entrega de bens ou a prestação de serviços e implementar para este fim controlos documentados no seio da sua organização interna.
• O PDF assinado permite dispensar a implementação de registo de auditoria, a CEGEDIM encarrega-se de assinar o PDF e arquivar a fatura eletrónica.